它负责统辖各地的军队、财政、法律等事务。而宣政院则负责全国范围内的事务，包括内务、军事、外交等。而宣政院是由清朝朝廷设立的中央机构，其成员由满、汉官员组成，直属皇帝领导，没有地方自治权力。总的来说，理藩院是清朝辖区治理的行政机构，宣政院是中央政权决策和执行的机构。两者的主要区别在于目的、范围和体制性质上的不同。
理藩院和宣政院是清朝两个不同的机构，它们的区别主要体现在以下几个方面：
1. 设立目的：理藩院设立的初衷是管理边疆地区和民族事务，负责辖区的治理、宣传、教化等工作；而宣政院则是清朝的最高行政机构，负责中央政府的决策、命令的发布和执行等工作。
2. 管辖范围：理藩院的辖区主要是边疆地区，包括满洲、东北、西北等。它负责统辖各地的军队、财政、法律等事务。而宣政院则负责全国范围内的事务，包括内务、军事、外交等。
3. 体制性质：理藩院属于地方自派机构，由满、汉、蒙古三族官员组成，它在边疆地区享有一定的自治权力。而宣政院是由清朝朝廷设立的中央机构，其成员由满、汉官员组成，直属皇帝领导，没有地方自治权力。
总的来说，理藩院是清朝辖区治理的行政机构，宣政院是中央政权决策和执行的机构。两者的主要区别在于目的、范围和体制性质上的不同。