外祖父意识到自己在梅花成长过程中对她所施加的束缚和限制。他明白了自己作为传统家长的错误和狭隘，意识到自己正在扼杀梅花的自由和追求幸福的权利。他为这样的错误而悔过，并为自己对梅花的不公平对待而流泪。他为自己未能为梅花创造更好的生活环境和条件而感到懊悔，因此流泪。
在小说《梅花魂》中，外祖父三次落泪的原因可以分别解释为：
第一次落泪：当外祖父得知自己骗过外孙女梅花后，他意识到自己的行为有失道义，不仅辜负了梅花无私的爱，也走上了背离正道的犯罪之路。他为自己的过错和对梅花的伤害而感到内疚，因此流泪。
第二次落泪：在小说的结尾，梅花将被迫与严格的传统婚姻观念和家族压力抗衡。外祖父意识到自己在梅花成长过程中对她所施加的束缚和限制。他明白了自己作为传统家长的错误和狭隘，意识到自己正在扼杀梅花的自由和追求幸福的权利。他为这样的错误而悔过，并为自己对梅花的不公平对待而流泪。
第三次落泪：在小说末尾，外祖父察觉到自己对梅花有一种父爱的情感，但这种情感并没有得到正当的表达和传达。他明白了自己曾经亏欠梅花的爱和对她的关怀，而没有给予她真正的理解和支持。他为自己未能为梅花创造更好的生活环境和条件而感到懊悔，因此流泪。
总的来说，外祖父的三次落泪都源自他对自己过去的错误行为和对梅花的伤害感到内疚、悔过和懊悔。他通过流泪来表达对梅花的爱和对自己的反思。